為解決原有科技計劃體系的重復、分散、封閉、低效等問題，進一步提高財政資金使用效益，國務院于2014年部署國家科技計劃管理改革，計劃在2016年底前完成改革主體任務，將原有的100多個科技計劃整合成國家自然科學基金、國家科技重大專項、國家重點研發計劃、技術創新引導專項(基金)、基地和人才專項五大類。其中，國家重點研發計劃是改革的重中之重，也是五類計劃中啟動最早的一項改革。
科技部副部長侯建國介紹說，國家重點研發計劃整合了原有的973計劃、863計劃、國家科技支撐計劃、國際科技合作與交流專項，發展改革委、工信部管理的產業技術研究與開發資金，以及有關部門管理的公益性行業科研專項等內容。計劃主要針對事關國計民生的農業、能源資源、生態環境、健康等領域中需要長期演進的重大社會公益性研究，以及事關產業核心競爭力、整體自主創新能力和國家安全的戰略性、基礎性、前瞻性重大科學問題、重大共性關鍵技術和產品、重大國際科技合作等。
他表示，國家重點研發計劃目前形成了59個重點專項的總體布局和優先啟動36個重點專項的相關建議，經國家科改領導小組審議通過后，現已得到國務院批準。
據悉，今后，由科技部、財政部、發展改革委等31個相關部門組成的部際聯席會議將負責審議重點專項的布局設置;由科技界、產業界和經濟界的高層次專家組成的特邀咨評委，將對重點專項的布局設置和任務分解等提出咨詢意見，為聯席會議決策提供參考;7家具備條件的科研管理類事業單位被確定為首批項目管理專業機構試點，將負責各重點專項中具體項目從受理評審到驗收的全流程管理。
記者還了解到，國家重點研發計劃在申報和評審方面有多處創新。其中，特邀咨評委委員及參與重點專項咨詢評議的專家，不能申請本人參與咨詢和論證過的重點專項項目;參與重點專項實施方案和年度指南編制的專家，不能申請和評審相關的重點專項項目;項目評審專家在遴選和具體評審中也嚴格執行相關回避條件和要求，“運動員”和“裁判員”將被徹底分開。